Отступы и комменты - это хорошо, но совершенно несерьёзно. Мои последние потребности, не удовлетворённые IDE, были примерно такими:
1. Компиляция и запуск J2MEUnit-тестов в специфической JRE. Построение списка failures со стеками вызовов.
2. Автоматический деплоймент исходников (Java) на Tomcat+Axis.
3. Рефакторинги C++, начиная от порога "Extract method". Rename member тоже потянет, и тут не всё просто.

EMACS на это способен? Это ЛЕГКО кастомизируется? :))) (это вообще не суть лёгкие задачи)